"# Mezcla de poblaciones celulares y resistencia a la radiación"
]
},
{
"cell_type": "code",
"execution_count": 1,
"metadata": {},
"outputs": [],
"source": [
"from pandas import read_csv\n",
"import matplotlib.pyplot as plt\n",
"import numpy as np\n",
"import random"
]
},
{
"cell_type": "markdown",
"metadata": {},
"source": [
"## Ejercicio\n",
"Se dispone de un archivo de texto (poblacion.csv) con valores en un arreglo de dimensión 101,101\n",
"Los valores posibles del arreglo son los enteros del 0 al 3. Este arreglo podría estar relacionado con una simulación usando un modelo de Potts celular.\n",
"En nuestro caso de interés los valores tienen la siguiente interpretación:\n",
"\n",
"* 0: no hay células\n",
"* 1: células aireadas\n",
"* 2: células hipóxicas\n",
"* 3: células muertas\n",
"\n",
"El objetivo de este ejercicio es simular el efecto de la radiación sobre este conjunto de células, usando un modelo de blanco simple.\n",
"\n",
"### Modelo:\n",
"La probabilidad de daño a una determinada célula es $p=1-e^{-D/Do}$, donde $Do=1$ Gy para las células tipo 1 y $Do=5$ Gy para las células tipo 2.\n",
"\n",
"### Instrucciones\n",
"* Represente gráficamente los datos del archivo, de forma que se pueda visualizar en que zona se encuentra cada tipo de célula.\n",
"* Simule la aplicación de diferentes dosis a réplicas de su población de prueba en un rango de 1 a 25 Gy. Utilice el modelo proporcionado para decidir si cada célula sobrevive o muere. \n",
"* Calcule la fracción de supervivencia en cada caso, tabule y grafique $\\ln(S)$ en función de $D$\n",
"* Tabule y grafique la proporción de células sobrevivientes tipo 2 con respecto al total de células sobrevivientes tipo 1 y 2 en función de la dosis.\n",
"* Indique qué propiedad de la curva resultante evidencia la resistencia diferencial de las sub poblaciones 1 y 2.\n",
"* Usted puede usar esta hoja para desarrollar la respuesta o cualquier otra herramienta a su alcance, siempre que el resultado sea razonablemente reproducible."
# Mezcla de poblaciones celulares y resistencia a la radiación
%% Cell type:code id: tags:
``` python3.6
from pandas import read_csv
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import random
```
%% Cell type:markdown id: tags:
## Ejercicio
Se dispone de un archivo de texto (poblacion.csv) con valores en un arreglo de dimensión 101,101
Los valores posibles del arreglo son los enteros del 0 al 3. Este arreglo podría estar relacionado con una simulación usando un modelo de Potts celular.
En nuestro caso de interés los valores tienen la siguiente interpretación:
* 0: no hay células
* 1: células aireadas
* 2: células hipóxicas
* 3: células muertas
El objetivo de este ejercicio es simular el efecto de la radiación sobre este conjunto de células, usando un modelo de blanco simple.
### Modelo:
La probabilidad de daño a una determinada célula es $p=1-e^{-D/Do}$, donde $Do=1$ Gy para las células tipo 1 y $Do=5$ Gy para las células tipo 2.
### Instrucciones
* Represente gráficamente los datos del archivo, de forma que se pueda visualizar en que zona se encuentra cada tipo de célula.
* Simule la aplicación de diferentes dosis a réplicas de su población de prueba en un rango de 1 a 25 Gy. Utilice el modelo proporcionado para decidir si cada célula sobrevive o muere.
* Calcule la fracción de supervivencia en cada caso, tabule y grafique $\ln(S)$ en función de $D$
* Tabule y grafique la proporción de células sobrevivientes tipo 2 con respecto al total de células sobrevivientes tipo 1 y 2 en función de la dosis.
* Indique qué propiedad de la curva resultante evidencia la resistencia diferencial de las sub poblaciones 1 y 2.
* Usted puede usar esta hoja para desarrollar la respuesta o cualquier otra herramienta a su alcance, siempre que el resultado sea razonablemente reproducible.
